上三旗是清代由皇帝直接统辖的三个旗。满洲八旗有上三旗和下五旗之分。清军入关前，正黄旗、镶黄旗、正蓝旗由皇太极亲自统领，是皇帝的亲兵，称为“上三旗”。余下的正红旗、镶红旗、镶白旗、正白旗、镶蓝旗，称为“下五旗”，由亲王、贝勒、贝子掌管，驻守各地。

入主中原后，多尔衮将自己所领的正白旗纳入上三旗，而将豪格统领的正蓝旗降入下五旗，此后未再变动。多尔衮病逝后，顺治皇帝接管正白旗的统领权。